Оки Сусуму возится с железками в машинном отсеке, перебирает клапаны, ругается с кока по поводу солярки на камбузе. Обычный механик, каких сотни. Только лодка, на которой он служит, не совсем обычная. Её собрал его отец, конструктор Оки Джузо, вложивший в корпус всё, что знал и умел. Супер 99 должна стать козырем против Океанской Империи, что уже прибрала к рукам мировые воды и топит всё, что плавает без её разрешения.

А потом выясняется, что приказы сверху пахнут не войной, а чьей-то личной игрой. Сусуму приходится чинить механизмы, которые кто-то другой намеренно выводит из строя, и молчать, когда рядом гибнут люди. Отец далеко, за тысячи миль, а здесь, в тесном отсеке, каждый сам решает, кому верить.

Экипаж воюет не только с чужими субмаринами. Свои тоже подкидывают задач. И чем глубже лодка уходит, тем меньше остаётся тех, на кого можно положиться. Кто отдал приказ, из-за которого погибла целая флотилия, и почему Супер 99 до сих пор не вскрыли изнутри?